Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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