Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IQSEC3Q9UPP2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms