Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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