Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms