Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms