Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms