Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP68Q9UHB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms