Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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