Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCO2Q9BYV7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms