Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms