Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms