Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD1Q9BXT4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms