Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNG6Q9BXT2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG6Q9BXT2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG6Q9BXT2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG6Q9BXT2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNG6Q9BXT2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms