Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC106Q9BWC9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms