Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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