Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms