Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUSC1Q9BVN2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms