Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM79Q9BSE2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms