Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms