Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms