Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCLRE1CQ96SD1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCLRE1CQ96SD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms