Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms