Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms