Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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