Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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