Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGLYRP3Q96LB9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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