Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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