Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms