Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF4BQ92750 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms