Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms