Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms