Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX33Q8WV41 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX33Q8WV41 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms