Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCOLN3Q8TDD5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms