Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms