Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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