Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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