Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms