Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF550Q7Z398 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms