Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms