Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP34Q70CQ2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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