Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms