Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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