Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms