Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms