Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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