Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO4Q2I0M5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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