Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGCAQ16586 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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