Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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