Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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