Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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